Храм Рождества Пресвятой Богородицы – подворье Николо- Пешношского мужского монастыря подворье епархиального мужского монастыря

В 1540-е гг. царь Иван Грозный после продолжительной болезни совершил паломничество в Кирилло-Белозерский монастырь. По дороге он остановился в Николо-Пешношском монастыре и сделал крупный денежный вклад. На эти средства в 1547 г. и было начато строительство каменного храма в честь Рождества Пресвятой Богородицы в селе Пустынь. В XVI  в. также была выстроена трехъярусная колокольня, перестроенная в 1871 г. В это же время из соседнего села Дулова в Медведеву Пустынь была перевезена деревянная Спасская церковь (в советское время храм сгорел).

С конца XVIII  в. по 1814 год на территории обители находилась богадельня. В XIX  в. храм Рождества Пресвятой Богородицы был реконструирован и заново освящен митрополитом московским Филаретом (Дроздовым).

В 1937 г. церковь закрыли, имущество разграбили.

В 1999 г. храм передан Православной Церкви.