Нижняя часть гроба, в котором были обретены мощи священномученика Сильвестра Омского
16 июля, который являлся днём закладки строящегося собора в 1891 году, археологи, производя раскопки, обрели сильно повреждённую икону Черниговской Божией Матери, которая всплыла из нижней южной части остатков собора, заполненной грунтовыми водами. На иконе с тыльной стороны явно виднелась надпись: «…епископу Сильвестру от почитателя…», подпись, дата «16 июля 1914» и печать. Затем стали всплывать кусочки ткани и остатки тела. После откачки воды из этой нижней комнаты был обнаружен гроб и вмонтированные над гробом в стену крест с иконой Киево–братской Божией Матери над ним. На кресте надпись «1918 год», это дата возведения преосвященного Сильвестра в сан архиепископа.
Захоронение находилось под мраморной плитой под лестницей и было замаскировано под пол в комнате, где проводились заупокойные богослужения. 21 июля 2005 года гроб с большей частью мощей был поднят. В нем были обнаружены остатки архиерейского облачения, чётки и «орлец», находящийся в ногах. На спине тела был найден монашеский параман, на дне гроба – четырёхгранный гвоздь, как орудие пыток и казни священномученика.
По благословению митрополита Омского и Тарского Феодосия в 2006 году нижняя часть гроба священномученика Сильвестра Омского была передана в дар Ачаирскому женскому монастырю для поддержания молитвенного подвига монахинь.