На заседании Священного Синода Русской Православной Церкви, состоявшемся 30 мая 2014 года в Санкт-Петербурге, было рассмотрено предложение Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла о преобразовании Патриаршего подворья Марфо-Мариинская обитель милосердия г. Москвы в ставропигиальный женский монастырь.
Синод принял решение преобразовать Патриаршее подворье в монастырь с сохранением особого уклада жизни, восходящего к основательнице обители преподобномученице Елисавете, и присвоением имени «ставропигиальный женский монастырь — Марфо-Мариинская обитель милосердия». Игуменией обители назначена монахиня Елисавета (Позднякова).
Также Синод определил, что в вопросах социального служения и дел милосердия новоучрежденный монастырь будет подчинятся Святейшему Патриарху Московскому и всея Руси через Синодальный отдел по церковной благотворительности и социальному служению, а в вопросах монашеской жизни — через Синодальный отдел по монастырям и монашеству (журнал № 52).